Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN2Q02246 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms