Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms