Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC10Q01780 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC10Q01780 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC10Q01780 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms