Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F1Q01094 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms