Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP11AP98196 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms