Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP4F8P98187 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F8P98187 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms