Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG7P83436 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG7P83436 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG7P83436 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG7P83436 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG7P83436 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG7P83436 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG7P83436 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms