Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP1P63208 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP1P63208 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP1P63208 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP1P63208 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP1P63208 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP1P63208 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP1P63208 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP1P63208 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP1P63208 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP1P63208 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP1P63208 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms