Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms