Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2FP61218 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms