Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00310P59036 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00310P59036 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms