Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RIPK4P57078 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK4P57078 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms