Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSCP56915 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSCP56915 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSCP56915 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GSCP56915 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSCP56915 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSCP56915 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSCP56915 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms