Protein–RNA interactions for Protein: P55318

FOXA3, Hepatocyte nuclear factor 3-gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA3P55318 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXA3P55318 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXA3P55318 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms