Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP7P55210 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP7P55210 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP7P55210 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP7P55210 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP7P55210 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP7P55210 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASP7P55210 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CASP7P55210 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP7P55210 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP7P55210 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP7P55210 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP7P55210 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASP7P55210 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CASP7P55210 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASP7P55210 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP7P55210 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms