Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms