Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLURP1P55000 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms