Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN5P54829 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN5P54829 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms