Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23BP54727 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms