Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms