Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MVDP53602 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MVDP53602 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MVDP53602 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MVDP53602 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MVDP53602 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MVDP53602 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MVDP53602 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MVDP53602 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MVDP53602 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MVDP53602 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms