Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ARFIP1P53367 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFIP1P53367 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms