Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP98P52948 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP98P52948 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP98P52948 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP98P52948 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP98P52948 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP98P52948 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP98P52948 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP98P52948 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP98P52948 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP98P52948 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP98P52948 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP98P52948 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP98P52948 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP98P52948 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP98P52948 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP98P52948 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP98P52948 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP98P52948 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP98P52948 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP98P52948 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP98P52948 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP98P52948 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP98P52948 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP98P52948 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms