Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN4P51793 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN4P51793 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms