Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HARS2P49590 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HARS2P49590 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HARS2P49590 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HARS2P49590 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HARS2P49590 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HARS2P49590 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HARS2P49590 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HARS2P49590 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HARS2P49590 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HARS2P49590 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HARS2P49590 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HARS2P49590 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms