Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM4SF4P48230 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF4P48230 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms