Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEDD4P46934 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms