Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOP2P46087 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOP2P46087 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOP2P46087 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOP2P46087 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NOP2P46087 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOP2P46087 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOP2P46087 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOP2P46087 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOP2P46087 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP2P46087 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP2P46087 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP2P46087 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOP2P46087 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms