Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTGIRP43119 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms