Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A4P43007 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms