Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF9P41273 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms