Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP8P40818 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP8P40818 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP8P40818 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP8P40818 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
USP8P40818 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP8P40818 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP8P40818 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP8P40818 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP8P40818 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP8P40818 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP8P40818 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP8P40818 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP8P40818 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP8P40818 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP8P40818 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP8P40818 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP8P40818 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP8P40818 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms