Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 CUR1YPR158W 759 nt4.96□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 HPR1YDR138W 2259 nt4.96□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 GCD2YGR083C 1956 nt4.96□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 SER33YIL074C 1410 nt4.96□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 HXT5YHR096C 1779 nt4.96□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 PHR1YOR386W 1698 nt4.96□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 ATG20YDL113C 1923 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 GDB1YPR184W 4611 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 LTV1YKL143W 1392 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 ELO2YCR034W 1044 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 GAL83YER027C 1254 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 FMP33YJL161W 543 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 ASG7YJL170C 630 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YJR037WYJR037W 384 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MED11YMR112C 396 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 TOM22YNL131W 459 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 snR10snR10 245 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YOR199WYOR199W 330 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 ARX1YDR101C 1782 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 FMP30YPL103C 1407 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 AGA1YNR044W 2178 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 UGA3YDL170W 1587 nt4.95□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 RRN3YKL125W 1884 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MCH4YOL119C 1506 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 CDC4YFL009W 2340 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 RAD53YPL153C 2466 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 PRM7YDL039C 2097 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 RPL16AYIL133C 600 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 CBP3YPL215W 1008 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 PBN1YCL052C 1251 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 SUC2YIL162W 1599 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 DBF4YDR052C 2115 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 GRS1YBR121C 2004 nt4.94□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 THR4YCR053W 1545 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YBR139WYBR139W 1527 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 SPB4YFL002C 1821 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 GEM1YAL048C 1989 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YCR050CYCR050C 309 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YDL163WYDL163W 303 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 RPS11AYDR025W 471 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 QCR10YHR001W-A 234 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 SOP4YJL192C 705 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 HRI1YLR301W 735 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 OCA2YNL056W 594 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YBR090CYBR090C 369 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 snR32snR32 188 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 DHR2YKL078W 2208 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 ESA1YOR244W 1338 nt4.93□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MCM4YPR019W 2802 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MGS1YNL218W 1764 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 CWC2YDL209C 1020 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MET32YDR253C 576 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YER006C-AYER006C-A 318 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 PEP8YJL053W 1140 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 PIR3YKL163W 978 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 RIM11YMR139W 1113 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YBL055CYBL055C 1257 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 EOS1YNL080C 1101 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MRP21YBL090W 534 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 NRM1YNR009W 750 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YNR021WYNR021W 1215 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YPL114WYPL114W 420 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MRPL51YPR100W 423 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YPR170CYPR170C 336 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YVC1YOR087W 2028 nt4.92□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 AVT5YBL089W 1380 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 POL12YBL035C 2118 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 UGA1YGR019W 1416 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 PUG1YER185W 912 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YER187WYER187W 426 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 COX13YGL191W 390 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 TAM41YGR046W 1158 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 SCW4YGR279C 1161 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YLR171WYLR171W 390 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 TDA5YLR426W 981 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MPD2YOL088C 834 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 MSN1YOL116W 1149 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 GCY1YOR120W 939 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 RPL21BYPL079W 483 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YRO2YBR054W 1035 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YSY6YBR162W-A 198 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 BUD14YAR014C 2130 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YMR046CYMR046C 1323 nt4.91□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 SRP1YNL189W 1629 nt4.9□□□□□ -1.62
YAR028WP39548 YCL075WYCL075W 441 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 UTR4YEL038W 684 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 LDB18YLL049W 540 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 BUR2YLR226W 1188 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 SWS2YNL081C 432 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 YPL088WYPL088W 1029 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 SEC66YBR171W 621 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.9□□□□□ -1.63
YAR028WP39548 RAD28YDR030C 1521 nt4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms