Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIK1P39086 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms