Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YCL076WYCL076W 744 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 IRC22YEL001C 678 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YEL010WYEL010W 351 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 TOS8YGL096W 831 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 PRP18YGR006W 756 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 PRP38YGR075C 729 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 MIC26YGR235C 702 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YAL065CYAL065C 387 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 REC102YLR329W 795 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SUI1YNL244C 327 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 RRP36YOR287C 903 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 OXR1YPL196W 822 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 FDH2YPL275W 711 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 OPY1YBR129C 987 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 MGA1YGR249W 1371 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YIG1YPL201C 1386 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 MEF1YLR069C 2286 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 NSP1YJL041W 2472 nt3.45□□□□□ -1.86
AVT5P38176 KRE5YOR336W 4098 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 AIM14YGL160W 1713 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 JHD2YJR119C 2187 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 ERT1YBR239C 1590 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 ATG21YPL100W 1491 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SNU23YDL098C 585 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 RPL24AYGL031C 468 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YGL088WYGL088W 366 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YGL117WYGL117W 798 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YGL132WYGL132W 336 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 RPC34YNR003C 954 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 ECM23YPL021W 564 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YBR063CYBR063C 1215 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 JID1YPR061C 906 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 MTR4YJL050W 3222 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 KIP3YGL216W 2418 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SPT6YGR116W 4356 nt3.44□□□□□ -1.86
AVT5P38176 ALO1YML086C 1581 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YOR022CYOR022C 2148 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 NOP6YDL213C 678 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 TAF10YDR167W 621 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 MEI4YER044C-A 1227 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SPI1YER150W 447 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SPT4YGR063C 309 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 PFS1YHR185C 714 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 PFK27YOL136C 1194 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 PSF3YOL146W 585 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YBR016WYBR016W 387 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YOR169CYOR169C 465 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 ICY2YPL250C 411 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 TDA6YPR157W 1404 nt3.43□□□□□ -1.86
AVT5P38176 UTP5YDR398W 1932 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 REF2YDR195W 1602 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YCR007CYCR007C 720 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YER076CYER076C 909 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 EFG1YGR271C-A 702 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SWC7YLR385C 399 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YLR456WYLR456W 615 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 FOL3YMR113W 1284 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YPT53YNL093W 663 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YNR071CYNR071C 1029 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 ATG5YPL149W 885 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 LAS1YKR063C 1509 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 ROK1YGL171W 1695 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SUP45YBR143C 1314 nt3.42□□□□□ -1.86
AVT5P38176 RTS1YOR014W 2274 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 KRE29YER038C 1395 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 CLG1YGL215W 1359 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SRB7YDR308C 423 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YGL214WYGL214W 486 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 CAP2YIL034C 864 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 CAB2YIL083C 1098 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 BNA1YJR025C 534 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 ATG33YLR356W 594 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 TMC1YOR052C 453 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 SME1YOR159C 285 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 VPS69YPR087W 321 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YPR177CYPR177C 372 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 FAA1YOR317W 2103 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 YNR066CYNR066C 1311 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 AGA1YNR044W 2178 nt3.41□□□□□ -1.86
AVT5P38176 MAL12YGR292W 1755 nt3.4□□□□□ -1.86
AVT5P38176 MAL32YBR299W 1755 nt3.4□□□□□ -1.86
AVT5P38176 PTA1YAL043C 2358 nt3.4□□□□□ -1.86
AVT5P38176 BCK2YER167W 2556 nt3.4□□□□□ -1.86
AVT5P38176 PRP11YDL043C 801 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 QRI7YDL104C 1224 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 NRG1YDR043C 696 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YGL108CYGL108C 423 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 COX4YGL187C 468 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 OST5YGL226C-A 261 nt3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms