Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FDFT1P37268 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FDFT1P37268 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms