Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACVR1BP36896 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms