Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM23P36406 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM23P36406 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms