Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT2P35908 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT2P35908 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT2P35908 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT2P35908 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT2P35908 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT2P35908 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT2P35908 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT2P35908 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT2P35908 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT2P35908 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT2P35908 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT2P35908 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT2P35908 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT2P35908 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT2P35908 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT2P35908 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT2P35908 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT2P35908 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT2P35908 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT2P35908 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms