Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN7P35236 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms