Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC1P33527 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC1P33527 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms