Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG3P32926 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG3P32926 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSG3P32926 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSG3P32926 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSG3P32926 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSG3P32926 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG3P32926 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG3P32926 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG3P32926 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG3P32926 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG3P32926 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG3P32926 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG3P32926 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG3P32926 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG3P32926 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG3P32926 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG3P32926 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG3P32926 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG3P32926 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG3P32926 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms