Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP1P32455 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP1P32455 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP1P32455 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP1P32455 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP1P32455 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP1P32455 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP1P32455 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP1P32455 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP1P32455 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP1P32455 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP1P32455 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP1P32455 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP1P32455 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP1P32455 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP1P32455 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP1P32455 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms