Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCKARP32238 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCKARP32238 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCKARP32238 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCKARP32238 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCKARP32238 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCKARP32238 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCKARP32238 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCKARP32238 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCKARP32238 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCKARP32238 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCKARP32238 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms