Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC13P31276 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms