Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHRNA5P30532 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA5P30532 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms