Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRMP28827 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRMP28827 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
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