Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRBP28702 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRBP28702 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRBP28702 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRBP28702 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRBP28702 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRBP28702 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRBP28702 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRBP28702 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRBP28702 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRBP28702 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRBP28702 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRBP28702 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRBP28702 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRBP28702 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRBP28702 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRBP28702 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRBP28702 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRBP28702 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRBP28702 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRBP28702 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRBP28702 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRBP28702 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRBP28702 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRBP28702 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRBP28702 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRBP28702 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRBP28702 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRBP28702 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRBP28702 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRBP28702 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRBP28702 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRBP28702 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRBP28702 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRBP28702 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRBP28702 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRBP28702 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRBP28702 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRBP28702 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RXRBP28702 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RXRBP28702 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RXRBP28702 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RXRBP28702 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RXRBP28702 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RXRBP28702 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms