Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXP28300 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXP28300 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXP28300 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXP28300 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXP28300 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXP28300 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXP28300 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXP28300 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms