Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA3P25788 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms